برزت الهيئة منذ ذلك الحين بصفتها آلية حقوق إنسان تعمل بكامل طاقتها لمتابعة أهدافها وولاياتها متعددة الأبعاد، فاعتمدت في دورتها العادية الأولى مجموعة من خمسة مبادئ توجيهية لعملها قدمها الأمين العام للمنظمة في بيانه الافتتاحي، وهي التكامل، والتأمل، وتحديد الأولويات، والنهج التدريجي والمصداقية. وضعت الهيئة خلال السنة الأولى من إنشائها قواعد إجراءاتها المفصلة، التي اعتمدتها الدورة التاسعة والثلاثين لمجلس وزراء الخارجية، وحددت مجالات الأولوية، وهي حقوق المرأة و الطفل، الحق في التعليم مع التركيز على التثقيف في مجال حقوق الإنسان , الإسلاموفوبيا / الأقليات المسلمة ,فلسطين. وعرضت الهيئة برامج لمساعدة الدول الأعضاء في مجموعة متنوعة من المجالات مثل تعزيز حقوق الإنسان، ومراجعة التشريعات المحلية، وتقديم المشورة فيما يتعلق بالالتزامات بموجب الصكوك الدولية لحقوق الإنسان، وحملات التوعية وتقديم المساعدة التقنية لبناء القدرات وغيرها.
